Синюха голубая, благодаря содержащимся в большом количестве биоактивным веществам, в частности сапонинам, оказывает выраженное многостороннее влияние на организм – нормализует обмен веществ. В медицине широко используют препараты из корневищ и корней синюхи голубой в качестве отхаркивающего средства для лечения воспалений легких и дыхательных путей (острых и хронических форм), туберкулеза, а также седативного и успокаивающего средства ЦНС при различных нервных и психических заболеваниях. Кроме того, растение в научной медицине применяют в качестве гипотензивного, кровоостанавливающего и ранозаживляющего средства при лечении язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки (для эпителизации и грануляции поврежденных тканей), при этом наибольший эффект достигается в комплексе с травой сушеницы топяной. Применение синюхи голубой в определенных дозах при атеросклерозе снижает количество холестерина в крови и положительно сказывается на свертываемости крови.