Медицинское применение корня аира болотного весьма велико. Корень аира помогает снять раздражительность, лечит неврозы, нарушения памяти и судороги. К его помощи прибегают при почечнокаменной болезни и заболеваниях желчного пузыря. В качестве полосканий это растение используется при зубной боли, кариесе, пародонтозе и прочих заболеваниях полости рта. Кроме того, в список болезней, поддающихся лечению корнем аира болотного, входят анемия, грипп, нарушения обмена веществ и гноящиеся раны. Одна из основных сфер использования этой части растения – кулинария, где корень аира служит заменителем многих приправ. Ещё большее применение он нашёл в народной медицине, где с его помощью лечат неврозы, нарушения менструального цикла, патологический климакс, заболевания ЖКТ, а также перхоть, зубную боль, кариес, грипп, нарушения памяти, судороги и огромное количество других заболеваний. Препараты, приготавливаемые из корня аира болотного, обладают спазмолитическими, противовоспалительными, успокаивающими и обезболивающими свойствами.В корне растения содержится достаточно большое количество эфирного масла чья доля доходит до 5%. Кроме того, в нём обнаружены валериановая и уксусная кислоты, фитонциды, борнеол, кариофиллен, гликозиды, горечи, дубильные вещества, смолы, крахмал, таннины и другие компоненты.